Seksi Manajemen Satker dan Kepatuhan Internal atau Seksi MSKI adalah salah satu seksi di KPPN Tipe A1.

Seksi MSKI mempunyai tugas di bidang manajemen satker yaitu melakukan pembinaan dan bimbingan teknis pengelolaan perbendaharaan, fungsi customer service, supervisi teknis SPAN dan helpdesk SAKTI, pemantauan standar kualitas layanan KPPN dan penyediaan layanan perbendaharaan.

Tugas di bidang kepatuhan internal yaitu pemantauan pengendalian intern, pengelolaan risiko, kepatuhan terhadap kode etik dan disiplin, dan tindak lanjut hasil pengawasan, perumusan rekomendasi perbaikan proses bisnis.